O Boqueirão Sul é uma bairro que fica no extremo sul de Ilha Comprida, na região das praias Ponta da Trincheira e Céu Azul. O principal acesso até o local é por balsa a partir de Cananéia.
O Boqueirão Sul fica 45 km distante do Boqueirão Norte e não existem vias que ligam os dois bairros. O acesso entre os bairros pode ser feito pela areia da praia (indicado para veículos 4×4) ou em um percurso de quase 100 km passando por Iguape e Cananéia.
A praia no Boqueirão Sul tem faixa de areia escura e dura, vegetação de restinga, dunas, piscinas naturais, mangue, e ondas boas para surfe. A Praia Ponta da Trincheira fica no extremo sul de Ilha Comprida, e tem vista para as ilhas do Bom Abrigo e do Cardoso.
Ao fundo do Boqueirão Sul passa o Canal do Mar Pequeno que divide Ilha Comprida com Cananéia. No Boqueirão Sul ficam as praias mais próximas da região central de Cananéia, que são bastante frequentadas pelos turistas e moradores dessa cidade.
O bairro é pouco urbanizado, assim como toda a região central e sul da ilha. A vegetação é bastante preservada. Para hospedagem existem hotel, pousadas e campings.
Hotéis e pousadas em Boqueirão Sul em Ilha Comprida
Hotel Intermares
Camping e Pousada Bom Abrigo
Camping e Pousada Âncora Azul